Etude prospective du MALDITOF sur la caractérisation fongique - Université de Lorraine Accéder directement au contenu
Mémoire / Rapport De Stage Année : 2015

Etude prospective du MALDITOF sur la caractérisation fongique

Résumé

Phytopathogenic fungi present a harmful aspect economically and environmentally. It is thus essential to develop tools in order to characterize and identify in a fast and reliable way. Thanks to the advent of molecular biology in the last few decades, great progress has been made in the identifying process of these fungi, by combining a morphologic method with a “barcoding” one. In spite of this, it is currently still difficult to discriminate between taxonomic ranks inferior to the species one. Mass spectrometry, and especially Maldi-Tof, is a technique frequently used for bacterial and yeast identification, but less so for fungal organisms. The aim of this study is to determine if the Maldi-Tof can be routinely used to identify photopathogenic fungi via a universal protocol, then to examine up to which taxonomic rank this technology can discriminate. In order to do so, we will use the Fusarium genus, a complex genus including many pathogenic species.
Les champignons phytopathogènes ont des rôles néfastes économiquement et dans l'environnement. Il est donc primordial de développer des outils d'identification et de caractérisation rapide et fiable. Grâce à l'avènement ces dernières décennies de la biologie moléculaire, un bond spectaculaire a été fait dans l'identification de ces champignons en combinant l'approche morphologique à une approche "barcoding". Malgré cela, à l'heure actuelle il est encore compliqué de discriminer des niveaux taxonomiques inférieurs à celui de l'espèce. La spectrométrie de masse, et plus particulièrement le Maldi-Tof, est une technique utilisée pour l'identification bactérienne et de levure mais encore peu pour les organismes fongiques. L'objet de l'étude est donc de déterminer si le Maldi-tof peut être utilisé en routine pour identifier les champignons phytopathogènes au travers d'un protocole universel puis de regarder plus précisément jusqu'à quel rang taxonomique cette technologie peut discriminer. Pour ce faire, nous allons utiliser le genre Fusarium qui est un genre complexe et comportant de nombreuses espèces pathogènes.

Domaines

Biotechnologies
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-01770446 , version 1 (19-04-2018)

Identifiants

  • HAL Id : hal-01770446 , version 1

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Citer

Jordhan Thuillier. Etude prospective du MALDITOF sur la caractérisation fongique. Biotechnologies. 2015. ⟨hal-01770446⟩
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