Deployment of a Clinical Data Warehouse in Nancy teaching hospital
Installation d’un entrepôt de données cliniques pour la recherche au CHRU de Nancy : déploiement technique, intégration et gouvernance des données
Abstract
L'apparition des dossiers patient informatisés et la collection croissante de données liées aux soins a permis l'émergence d'entrepôts de données pouvant être utilisés en recherche clinique pour identifier et retrouver les données liées à un groupe de patients. La plateforme i2b2 choisie ici est à la fois un entrepôt et un outil de requêtes, disponible sous licence open source. L'objectif était l'étude de la faisabilité du déploiement de la plateforme i2b2 au CHRU de Nancy, explorant la représentation et l'intégration des données du SIH, et les règles de gouvernance. Un package R (R2b2) a été développé spécifiquement, permettant de gérer l'entrepôt, manipuler et intégrer les données. Les sources de données existantes dans le SIH ont été étudiées pour leur intégration, et un modèle de représentation des données a été choisi (ou conçu lorsque cela était nécessaire) pour organiser les concepts. Un dispositif a été mis en place pour protéger l'accès aux données, en miroir de la responsabilité médicale au CHRU et respectant les règles de collection et d'accès aux données de soins, permettant un retour direct aux praticiens. Un prototype fonctionnel est fourni, intégrant les données de 118330 patients lors de 247580 hospitalisations depuis début 2016, totalisant plus de 18 millions d'observations. Le travail conduit autour de ce prototype a permis de dégager plusieurs axes de conduite pour la mise en production du projet, et les règles régissant les accès.
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