Recherche de nouveaux gènes cibles dans le génome humain pour les récepteurs activés par les proliférateurs de péroxysomes (PPAR) : découverte du gène codant la sémaphorine 6B - Université de Lorraine Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2004

Recherche de nouveaux gènes cibles dans le génome humain pour les récepteurs activés par les proliférateurs de péroxysomes (PPAR) : découverte du gène codant la sémaphorine 6B

Philippe Collet
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 757103
  • IdRef : 07713950X

Résumé

Peroxisome proliferator activated receptors (PPAR) are transcription factors. Their belong to the nuclear receptor superfamily and play roles in cell cycle as well as fatty acids and sugar metabolisms. Various PPAR agonists are known : unsaturated fatty acids, ecosanoïds and pharmaceutical compounds. Once PPAR is activated, it binds to retinoïc acid receptor (RXR). Thus the dimer is recruit on the PPAR's responsive element (PPRE). Sequences of known PPRE are made of two AGGTCA motif spaced by one nucleotide. We performed an immunoselection of PPRE sequence from human genomic DNA, in order to harvest new PPRE sequences (ISF). Sequence analysis of these ISF allow us to discover that a protein implicated in "axon guidance" called "semaphorin 6B" is a novel target gene for PPAR.
Les récepteurs activés par les proliférateurs de peroxysomes (PPAR) sont des facteurs de transcription de la superfamille des récepteurs nucléaires. Ces facteurs de transcription sont impliqués dans la vie cellulaire et dans le métabolisme lipidique et glucidique. Les agonistes de PPAR sont variés : acides gras insaturés, eicosanoïdes, et molécules synthétiques. Les PPAR hétérodimérisés avec les récepteurs de l'acide 9-cis rétinoïque (RXR) se fixent sur des éléments de réponse (PPRE) situés en amont des gènes dont ils contrôlent l'activité transcriptionnelle. Ces PPRE sont des motifs AGGTCA répétés et séparés par un nucléotide (DR1). Notre stratégie fut d'immunosélectionner des fragments (ISF), capables de fixer les PPAR. Une recherche bio-informatique a permis de localiser ces ISF dans le génome humain et identifier les gènes situés à proximité. Nos travaux révèlent que la sémaphorine 6B, une protéine qui intervient dans la guidance des axones, est une cible des PPAR.
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Dates et versions

tel-01746538 , version 1 (29-03-2018)

Identifiants

  • HAL Id : tel-01746538 , version 1

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Citer

Philippe Collet. Recherche de nouveaux gènes cibles dans le génome humain pour les récepteurs activés par les proliférateurs de péroxysomes (PPAR) : découverte du gène codant la sémaphorine 6B. Biochimie, Biologie Moléculaire. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 2004. Français. ⟨NNT : 2004NAN10002⟩. ⟨tel-01746538⟩
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