Le sol est au cœur de l’écosystème agricole et joue un rôle majeur dans la production de biens et dans la fourniture de différents services écosystémiques qui régulent la production. La transition agroécologique passe par une transformation des systèmes agricoles basée une substitution d’intrants par des services écosystémiques. Ceci nécessite d’être soutenu par des démarches d’évaluation tout au long du processus, à la fois pour un diagnostic initial de la situation de départ et pour évaluer les changements produits par la transition. Il n’est généralement pas possible de mesurer directement ni la qualité, ni la santé des sols et il faut donc se fier à des indicateurs indirects d’une évaluation environnementale qui prennent des formes variées. L’objectif de cet article est de dresser la revue des indicateurs disponibles pour évaluer les impacts des pratiques agricoles sur la fertilité, la qualité et la santé des sols. Pour ces enjeux, les indicateurs les plus utilisés reposent sur des mesures de terrain. Ils sont complétés par d’autres indicateurs prédictifs prisés par les agronomes qui cherchent à travailler à l’amélioration des systèmes de culture ou la conception de systèmes innovants. Plusieurs questions restent à approfondir comme celle des valeurs de références, de la qualité prédictive des indicateurs, notamment en lien avec les services écosystémiques comme celui de régulation des bioaggresseurs.