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Master thesis

Typage de staphylococcus aureus par MLVA : étude de faisabilité de la détection par HRM

Résumé : Staphylococcus aureus est un agent pathogène majeur de l'homme. Cette espèceest capable d'acquérir à la fois de nombreux facteurs de virulence et de multiplesrésistances aux antibiotiques. Le fort pouvoir de dissémination des souches peutêtre à l'origine d'épidémies d'infections graves en l'absence de moyens de prévention adaptés. Le typage épidémiologique joue un rôle important dans la compréhension de leur transmission et permet d'organiser une prévention opérationnelle et efficace. De nombreuses méthodes de typage de Staphylococcus aureus ont été développées, dont la MLVA qui se démarque par son pouvoir discriminant. L'association de la MLVA à l'HRM a été proposée dans ce travail dans le but d'accroitre l'accessibilité d'un laboratoire au génotypage. Cette technologie, encore peu employée, est simple, reproductible, rapide, possède un faible coût et a déjà fait ses preuves dans de nombreuses applications. Ce travail a été réalisé en deux étapes. Après une phase d'optimisation des PCR quantitatives des différents VNTR réalisée avec succès, des souches cliniques hétérogènes, préalablement typées pour les mêmes VNTR par MLVAtraditionnelle, ont été utilisées pour tester le pouvoir discriminant de l'HRM. L'absence de corrélation entre les révélations par migration électrophorétique et celles obtenues par HRM ne permet pas de proposer l'utilisation de cette dernière comme alternative simple à la migration en gel d'agarose. Différentes hypothèses ont été évoquées pour expliquer cette absence de corrélation. Un séquençage des amplicons obtenus serait nécessaire pour valider ces hypothèses
Document type :
Master thesis
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01733242
Contributor : Colette Orange <>
Submitted on : Wednesday, March 14, 2018 - 3:42:11 PM
Last modification on : Friday, May 1, 2020 - 3:36:04 PM
Long-term archiving on: : Wednesday, September 5, 2018 - 2:37:53 AM

File

BUMED_T_2013_PEREZ_PASCALE.pdf
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  • HAL Id : hal-01733242, version 1

Citation

Pascale Perez. Typage de staphylococcus aureus par MLVA : étude de faisabilité de la détection par HRM. Sciences du Vivant [q-bio]. 2013. ⟨hal-01733242⟩

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