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Master thesis

Modélisation de l'instabilité plasmidique segrégationnelle de souches recombinées: application à Escherichia coli

Résumé : Nous avons étudié en modélisation le phénomène d'instabilité plasmidique ségrégationnelle chez la souche recombinée E.coli HBIOI (GADPH) . Après avoir défini les modèles sur le plan théorique, nous avons réalisé lesidentifications paramétriques à partir des résultats expérimentaux d'une fermentation en continu, à l'aide d'un algorithme de type Simplex. Les modèles ainsi obtenus ont été confrontés à des résultats expérimentaux enculture batch. L'application dans un premier temps d'un modèle simple non ségrégué permet de simuler de façon satisfaisante l'évolution de la souche. Nous proposons ensuite un modèle ségrégué, basé sur le fait qu'une culture de cellules recombinantes est une culture mixte où coexistent plusieurs souches différentiées par leur nombre de copies de plasmides variant de 0 à N. Ce modèle explicite le bilan des fractions de biomasse et différentie la cinétique de croissance des souches bactériennes de celle de réplication plasmidique. De plus, nousavons défini pour cc modèle deux expressions de la probabilité de perte de plasmides, l'une basée sur une distribution de répartition uniforme, l'autre sur une distribution de type binomial. le modèle de probabilité de répartition uniforme, même s'il permet de simuler de façon satisfaisante les données expérimentales, ne constitue pas un modèle suffisant du fait de la valeur improbable d'un de ses paramètres . Le modèle de probabilité de distribution binomiale permet lui d'avoir une approche des phénomènes d'instabilité, d'autres facteurs restantsans doute à prendre en compte pour une modélisation optimale.
Document type :
Master thesis
Complete list of metadatas

https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01733340
Contributor : Colette Orange <>
Submitted on : Wednesday, March 14, 2018 - 3:47:17 PM
Last modification on : Friday, May 1, 2020 - 3:43:36 PM
Long-term archiving on: : Wednesday, September 5, 2018 - 2:40:26 AM

File

SCDPHA_T_2000_LE_BAO_LINH.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : hal-01733340, version 1

Citation

Bao-Linh Le. Modélisation de l'instabilité plasmidique segrégationnelle de souches recombinées: application à Escherichia coli. Sciences pharmaceutiques. 2000. ⟨hal-01733340⟩

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