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Master thesis

Evaluation de la carte Vitek® 2 ANC pour l'identification des bactéries anaérobies et des corynébactéries d'intérêt médical

Résumé : Les bactéries anaérobies et les corynébactéries sont souvent des pathogènes opportunistes pour l'homme, dont la recherche et l'identification s'effectuent dans des contextes particuliers. L'identification s'appuie souvent sur la détermination de caractères phénotypiques, comprenant l'étude des différents métabolismes, pouvant être réalisée à l'aide de systèmes commercialisés dont certains sont automatisés. La carte Vitek® 2 ANC (bioMérieux), introduite sur le marché en 2008, permet l'identification rapide (en 6 heures) et automatisée de 63 taxons comportant des bactéries anaérobies et des corynébactéries. L'objet de notre étude a été d'évaluer les performances de cette carte au laboratoire de Bactériologiedu CHU de Nancy, vis-à-vis de 315 souches cliniques appartenant à des espèces revendiquées par la base de données, et de 19 souches appartenant à des espèces non revendiquées.Parmi les 315 souches cliniques, 98,7 % ont été d'emblée correctement identifiées au niveau du genre, et 88,5 % au niveau de l'espèce. Les souches appartenant aux Bacteroides du groupe fragilis, à l'espèce B. ureolyticus, au genre Fusobacterium, aux cocci, aux bacilles à Gram positif non sporulés et aux genres Corynebacterium et Arcanobacterium, ont été bien identifiées. Les performances ont été moins bonnes pour l'identification des Prevotella spp.Des problèmes ont été rencontrés pour l'identification des clostridia, qui nécessite souvent le recours à des tests additionnels allongeant le délai de réponse d'au moins 24 heures.Globalement, nos résultats montrent que le système Vitek® 2 ANC est plus performant que les autres systèmes d'identification biochimique commercialisés pouvant être utilisés en routine.Néanmoins, ce système pourrait être amélioré par l'incorporation d'autres tests dans la carte, l'addition d'autres tests complémentaires et par l'intégration dans la base de données d'autres espèces de bactéries anaérobies et de corynébactéries susceptibles d'être rencontrées en pathologie humaine.Le système Vitek® 2 ANC est une méthode simple, rapide et satisfaisante pour l'identification des principales espèces de bactéries anaérobies et de corynébactéries fréquemment isolées dans un laboratoire de bactériologie médicale. La rapidité d'un tel système pourrait cependant être remise en cause par d'autres techniques émergentes, telles que la spectrométrie de masse permettant notamment l'identification fiable de micro-organismes en quelques minutes.
Document type :
Master thesis
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-01738876
Contributor : Colette Orange <>
Submitted on : Tuesday, March 20, 2018 - 5:31:22 PM
Last modification on : Friday, May 1, 2020 - 3:43:58 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, September 11, 2018 - 9:08:03 PM

File

SCDPHA_T_2009_MATUSZEWSKI_CELI...
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  • HAL Id : hal-01738876, version 1

Citation

Céline Matuszewski. Evaluation de la carte Vitek® 2 ANC pour l'identification des bactéries anaérobies et des corynébactéries d'intérêt médical. Sciences pharmaceutiques. 2009. ⟨hal-01738876⟩

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