Caractérisation des gènes bactériens codant pour des enzymes lignolytiques dans différents environnements
Résumé
Le but de cette étude consiste à rechercher des micro-organismes d’intérêts (responsable de la dégradation de la lignine) de par leur activité enzymatique (sécrétion d’oxydases) de façon indirecte (en prospectant leur gènes) dans différentes matrices (milieux aérobies, digestats anaérobies, milieux plus ou moins riches en lignine, …). Les outils de biologie moléculaire seront utilisés pour cette prospection. Tout d’abord, la recherche et/ou la construction d’amorces spécifiques aux gènes codant pour ces oxydases permettra de mettre en évidence leur présence ou leur absence au sein des matrices testées. Les produits obtenus seront ensuite clonés puis séquencés afin d’identifier les espèces possédant ces gènes d’oxydase. Enfin, la concentration de ces gènes d’oxydases dans les différentes matrices sera aussi quantifiée par PCR quantitative.
Domaines
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