Analysis of QTL for branching traits on Quercus robur, observed by X-ray tomography
Analyse QTL de la ramification du chêne pédonculé, observée par tomographie à rayon X
Abstract
In this study, an analysis of Quantitative Trait Loci (QTL) was undertaken based on a genetic map with 686 markers and 179 sample individuals of Quercus robur, produced by an intra-specific crossing. Quantitative data were measured by interpreting scanned images, obtained by X-ray tomography. 38 QTLs were detected with an explained variation of 4% to 11.7% on 16 of the 24 chromosomes. These QTLs corresponded to: 1) the numbers of suppressed buds, epicormic shoots and sequential branches; 2) the volume of trunk and branch knots; 3) the presence of forks. This study evidenced a strong genetic effect on the production and the bud break of primary buds; the environmental effect is much more considerable for secondary buds. The importance of a genetic determinism for the epicormic shoots was confirmed. Few QTLs related to architecture were found. More individuals or more repetitions may probably allow their detection.
Dans cette étude, une analyse de Quantitative Trait Loci (QTL) a été réalisée à partir d'une carte génétique comportant 686 marqueurs et un jeu de 179 individus de Quercus robur L. provenant d'une croisement intra-spécifique. Les données quantitatives sont mesurées par l'interprétation d'images scannées, obtenues par tomographie à rayon X. 38 QTLs ont été détectés et une variation de 4% à 11.7% estimée sur 16 de 24 chromosomes. Ces QTLs correspondent : 1) au développement de bourgeons latents, de gourmands et de branches; 2) au volume de tronc et de noeud de branche ; 3) à la présence de fourche. Cette étude démontre un effet génétique fort pour les nombres et le débourrement des bourgeons primaires ; l'effet environnemental est plus considérable pour le bourgeon secondaire. L'importance du déterminisme génétique des gourmands est confirmée. Peu de QTL correspondant à l'architecture ont été trouvés, mais il serait possible de les détecter avec plus d'individus ou plus de répétitions.
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