Les analyses de flux métaboliques (AFM) nécessitent le marquage isotopique du précurseur de la voie métabolique étudiée. Dans le cadre de l'étude de la voie des polyphénols de la tomate sous l'influence de facteurs environnementaux, l'équipe dédiée du laboratoire agronomie et environnement avait besoin d'une méthode d'introduction de phénylalanine marquée au carbone 13 dans différents organes de plants de tomates (feuilles et racines). L'objectif de ce stage a été cette mise au point méthodologique. Pour cela, différentes modalités d'introduction de phénylalanine marquée ont été testées. Ces tests ont été accompagnés par des suivis de teneurs en différents métabolites marqués et non marqués de la voie (phénylalanine, acide chlorogénique, rutine et kaempférol-rutinoside). Les taux d'enrichissement de ces composés ont été calculés. Des suivis de la physiologie de la plante ont également été réalisés ; ainsi que des mesures de l'expression de certains gènes clés impliqués dans la voie. L'ensemble de ces données permet de discuter l'intérêt des différentes modalités évaluées. Des résultats satisfaisants pour les racines ont été obtenus en cultivant en hydroponie des plantes entières avec une solution nutritive contenant le précurseur marqué. Les résultats pour les feuilles sont mitigés mais il semble que cette méthode puisse également marquer correctement les tissus foliaires.