L’antibiorésistance bactérienne est actuellement un enjeu majeur de santé publique. Il existe des systèmes de surveillance concernant les animaux terrestres : bovins, porcins et volaille. Aucun système de surveillance n’est cependant actuellement mis en place pour les produits de la mer alors que la consommation des produits de la mer constitue une part importante de la consommation française (34,5 kg/habitant/an) et mondiale (20 kg/habitant/an). Cette étude propose le développement d’une puce de qPCR très haut débit (Fluidigm) afin de détecter les gènes d’antibiorésistance d’importance critique en santé humaine. L’étude a permis de valider 40 marqueurs de gènes de résistance pour les bactéries Gram négatives. Nous avons ainsi détecté quatre gènes d’antibiorésistance et un gène signature de plasmide dans une collection de 159 souches Gram négatives isolées des produits de la mer principalement consommés en France. Cet outil pourra être utilisé afin de suivre l’introduction de gènes de résistance aux antibiotiques dans la chaîne alimentaire.