Détection de gènes de résistance aux antibiotiques dans les bactéries isolées des produits de la mer - Université de Lorraine Access content directly
Master Thesis Year : 2018

Détection de gènes de résistance aux antibiotiques dans les bactéries isolées des produits de la mer

Emilie Dauvergne
  • Function : Author
  • PersonId : 1218453
  • IdRef : 267132093

Abstract

Nowadays, bacterial antimicrobial resistance constitutes a challenge in public health. In the European Union surveillance systems monitor antimicrobial resistance in terrestrial food animals: bovine, pigs and poultry. No monitoring system currently exists for seafood even if the consumption of seafood is important (34.5 kg/inh/year consumed in France and 20 kg/inh/year worldwide). In this study we developed a high-throughput qPCR chip to detect antimicrobial resistance genes with a critical importance in human health. We validated qPCR tests targeting 40 antimicrobial resistance genes for Gram-negative bacteria. This method allowed us to detect four antimicrobial resistance genes and one plasmid-associated gene in a collection of 159 Gram-negative bacterial strains isolated from seafood products. This tool will be useful to follow the introduction and dissemination of antimicrobial resistance genes in the food chain.
L’antibiorésistance bactérienne est actuellement un enjeu majeur de santé publique. Il existe des systèmes de surveillance concernant les animaux terrestres : bovins, porcins et volaille. Aucun système de surveillance n’est cependant actuellement mis en place pour les produits de la mer alors que la consommation des produits de la mer constitue une part importante de la consommation française (34,5 kg/habitant/an) et mondiale (20 kg/habitant/an). Cette étude propose le développement d’une puce de qPCR très haut débit (Fluidigm) afin de détecter les gènes d’antibiorésistance d’importance critique en santé humaine. L’étude a permis de valider 40 marqueurs de gènes de résistance pour les bactéries Gram négatives. Nous avons ainsi détecté quatre gènes d’antibiorésistance et un gène signature de plasmide dans une collection de 159 souches Gram négatives isolées des produits de la mer principalement consommés en France. Cet outil pourra être utilisé afin de suivre l’introduction de gènes de résistance aux antibiotiques dans la chaîne alimentaire.
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Dates and versions

hal-02010604 , version 1 (07-02-2019)

Identifiers

  • HAL Id : hal-02010604 , version 1

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Cite

Emilie Dauvergne. Détection de gènes de résistance aux antibiotiques dans les bactéries isolées des produits de la mer. Microbiologie et Parasitologie. 2018. ⟨hal-02010604⟩
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