Etude de l'impact des pratiques agricoles sur les capacités fonctionnelles des communautés microbiennes en lien avec le recyclage de la matière organique - Université de Lorraine Access content directly
Master Thesis Year : 2019

Etude de l'impact des pratiques agricoles sur les capacités fonctionnelles des communautés microbiennes en lien avec le recyclage de la matière organique

Abstract

The objective of this work is to study the impact of agricultural practices on soil respiration through the microbial communities involved in the degradation of organic matter (OM). This experiment is carried out under controlled conditions (microcosms) on two types of soils subjected to different agricultural practices (grassland and cropland). This study is based on the complementarity of molecular and functional approaches. On the one hand, molecular analyzes visualize the impact of these practices on the microbial communities present in the soil through an estimation of microbial biomass and the density of fungal and bacterial communities. On the other hand, functional analyzes make it possible to observe the impact of these practices on soil respiration by quantifying the CO2 fluxes associated with the degradation of OM. Consequently, the analysis of the influence of microorganisms in OM degradation related to agricultural practices is possible.
L’objectif de ce travail est d’étudier l’impact des pratiques agricoles sur la respiration du sol à travers les communautés microbiennes impliquées dans la dégradation de la matière organique (MO). Cette expérimentation est réalisée en conditions contrôlées (microcosmes) sur deux types de sols soumis à des pratiques agricoles différentes (prairie et culture). Cette étude est basée sur la complémentarité d’approches moléculaires et fonctionnelles. D’une part, les analyses moléculaires permettent de visualiser l’impact des pratiques sur les communautés microbiennes présentes dans le sol grâce à une estimation de la biomasse microbienne et à la densité des communautés fongiques et bactériennes. D’autre part, les analyses fonctionnelles permettent d’observer l’impact des pratiques sur la respiration du sol grâce à la quantification des flux de CO2 liés à la dégradation de la MO. Par conséquent, l’analyse de l’influence des microorganismes dans la dégradation de la MO lié aux pratiques agricoles est possible.
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Dates and versions

hal-02548957 , version 1 (21-04-2020)

Identifiers

  • HAL Id : hal-02548957 , version 1

Cite

Oceane Geisler. Etude de l'impact des pratiques agricoles sur les capacités fonctionnelles des communautés microbiennes en lien avec le recyclage de la matière organique. Microbiologie et Parasitologie. 2019. ⟨hal-02548957⟩
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