Développement d'un logiciel de gestion du génotypage VIH-1 au laboratoire de biologie médicale : interprétation, épidémiologie et aide au management de la qualité - Archive ouverte HAL Access content directly
Master Thesis Year : 2018

Développement d'un logiciel de gestion du génotypage VIH-1 au laboratoire de biologie médicale : interprétation, épidémiologie et aide au management de la qualité

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Abstract

La biologie médicale compte parmi les professions de santé les plus informatisées. Pourtant, certaines analyses complexes et non automatisées ne sont pas encore pleinement maîtrisées par un système informatique efficient. C'est notamment le cas de l'évaluation génotypique de la résistance du VIH aux antirétroviraux qui constitue une étape critique de la prise en charge des patients vivant avec le VIH. Les besoins inhérents à cette analyse ont conduit au développement d'une application originale capable d'automatiser l'interprétation des données issues du séquençage viral (de manière isolée ou cumulée selon un algorithme défini) et le suivi épidémiologique des mécanismes de résistances associés. Cette application facilite également la démarche d'accréditation du laboratoire selon la norme NF EN ISO 15189 en permettant la gestion des contrôles internes de qualité, le calcul d'indicateurs de performance analytique et la maîtrise des consommables critiques. L'application, sécurisée, autonome et open source, offre également la possibilité aux biologistes médicaux de paramétrer sous interface graphique la plupart des éléments amenés à évoluer dans le temps (algorithmes d'interprétations, molécules antirétrovirales, …) et possède un suivi complet de la traçabilité et de la gestion des utilisateurs. Le cycle de développement de cette application, allant de sa présentation contextuelle à son analyse logicielle, ainsi que ses fonctionnalités sont présentés dans ce travail. Une version de démonstration est disponible sur le site .
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BUPHA_T_2018_KEBBABI_CLEMENT.pdf (5.71 Mo) Télécharger le fichier
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Dates and versions

hal-03297597 , version 1 (23-07-2021)

Identifiers

  • HAL Id : hal-03297597 , version 1

Cite

Clément Kebbabi. Développement d'un logiciel de gestion du génotypage VIH-1 au laboratoire de biologie médicale : interprétation, épidémiologie et aide au management de la qualité. Sciences pharmaceutiques. 2018. ⟨hal-03297597⟩
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