Etablissement de modèles métaboliques de Desulfovibrio vulgaris et de Clostridium acetobutylicum
Résumé
The use of bio-hydrogen in the French energy mix is one of the solutions to increase the share of renewable energy in this mix. The EPIC-H2 project, which involveseveral laboratories, studies the production of hydrogen by a bacterial community composed of Desulfovibrio vulgaris and Clostridium acetobutylicum. This study is carried out using several approaches, especially by modeling and simulating the metabolic interactions between the two bacteria. This work constituted the first step of this project. Its goal was to identify and to validate some metabolic models of each of these bacteria. Two models for D. vulgaris (Zomorrodi et al, 2012; Flowers et al, 2018) have been studied, modified and compared to experimental data. For C. acetobutylicum, a model (Dash et al, 2016) was found in the literature, but further studies are needed to validate it.
L’utilisation de bio-hydrogène est envisagée dans le mix énergétique français afin d’accroitre la part d’énergie renouvelable dans ce dernier. Le projet EPIC-H2, porté par plusieurs laboratoires, compte étudier la production d’hydrogène par une communauté bactérienne composée de Desulfovibrio vulgaris et de Clostridium acetobutylicum. Cette étude se fera sous plusieurs angles et notamment en modélisant et en simulant les interactions métaboliques entre les deux bactéries. Ce stage constituait la première étape de ce projet. Il avait pour objectif d'identifier et de valider des modèles métaboliques pour ces bactéries. Deux modèles métaboliques de D. vulgaris (Zomorrodi et al, 2012 ; Flowers et al, 2018) ont été étudiés, complétés et confrontés à des résultats expérimentaux. Pour C. acetobutylicum, un modèle (Dash et al, 2016) a été identifié mais il devra être validé par des études complémentaires.