Study of the biogenesis, structure, evolution and function of yeast U3 snoRNA
Etude de la biogenèse, de la structure, de l'évolution et du mécanisme d'action du snoRNA U3 de levures
Abstract
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Le petit ARN nucléolaire U3 joue un rôle essentiel pour la maturation des ARN ribosomiques chez les eucaryotes. Il est essentiel pour la production de l'ARNr 18S. Le snoRNA U3 est codé par deux gènes chez la levure S. cerevisiae et notre équipe avait fait l'observation inattendue de la présence d'un intron épissé dans un spliceosome dans ces deux gènes. La structure secondaire du snoRNA U3 en solution avait été établie. Dans un premier temps, nous avons étudié la structure secondaire du précurseur du snoRNA U3A, ce qui a impliqué à la fois une étude expérimentale de l'ARN sauvage par emploi de sondes chimiques et enzymatiques et la production et l'étude de la structure secondaire de nombreux mutants afin d'aboutir à une proposition unique de structure secondaire en accord avec tous les résultats expérimentaux. Selon le modèle ainsi établi, une large part des motifs structuraux présents dans l'ARN mature sont déja formés dans le précurseur et l'intron est lui-même fortement structuré avec une longue structure tige-boucle centrale et une boîte 5' appariée au premier exon. Nous avons montré qu'en dépit des différences de séquences de l'intron, le précurseur du snoRNA U3B a la même architecture, d'où l'idée de l'influence de la structuration du précurseur sur l'efficacité d'épissage. C'est ce que nous avons pu confirmer par une étude de la relation structure-efficacité d'épissage de l'ARN précurseur basée sur la production de précurseurs mutés, l'étude de leur structure secondaire et de leur efficacité d'épissage in vitro et in vivo. Nous avons en particulier pu montrer l'additivité des effets de la présence de la boîte de branchement sous-optimale et d'un appariement de la boîte 5' et l'importance de la structure de la tige-boucle centrale. Ces travaux m'ont amené à développer un test génétique chez S. cerevisiae de la fonctionnalité du gène du snoRNA U3. [...]