Genetic polymorphism and molecular typing in the bacteria streptococcus salivarius subsp. thermophilus - Archive ouverte HAL Access content directly
Theses Year : 1991

Genetic polymorphism and molecular typing in the bacteria streptococcus salivarius subsp. thermophilus

Polymorphisme génétique et typage moléculaire chez la bactérie streptococcus salivarius subsp. thermophilus

(1)
1
Catherine Colmin
  • Function : Author
  • PersonId : 787579
  • IdRef : 177805617

Abstract

Not available
La réalisation de profils de restriction de l'ADN a permis de mettre en évidence l'existence d'un polymorphisme génomique intraspécifique chez streptococcus salivarius subsp. thermophilus. A partir de l'ADN de la couche nst7, un fragment de 4,2 kb appelé i21 a été cloné dans le plasmide pbr322. Utilisé comme sonde sur des profils de restriction NDEII et HAEIII des ADN des 28 souches, ce fragment permet de révéler le polymorphisme génomique. Sur la base de ces résultats, il est possible de classer ces souches en 10 groupes dont 5 ne comprennent qu'une seule souche. La nature polymorphe du locus i21 a été mise en évidence : le génome de toutes les souches examinées ne contient pas la totalité de ce fragment. Des hybridations ont été réalisées en utilisant séparément comme sonde trois parties de ce fragment. Ces expériences ont permis de montrer que pour les 8 souches examinées, il existe au moins 7 situations différentes caractérisées chacune par une structure particulière de cette région du génome. Un deuxième fragment d'ADN qui semble affecté par le même type de phénomène a été mis en évidence. D'autre part, la partie c du fragment i21 contient une séquence de taille inferieure ou égale a 1 kb qui est répétée dans les génomes de toutes les souches de s. salivarius subsp. thermophilus examinées. Le degré de spécificité de la sonde pnst21 a été testé par hybridation sur les ADN de 34 souches appartenant à 19 espèces différentes de s. salivarius subsp. thermophilus et cette sonde s'est révélée être spécifique de l'espèce s. salivarius. La sonde pnst21 a été hybridée sur les ADN de 107 souches de s. salivarius subsp. thermophilus appartenant a la collection du CNRZ. Des ribotypes des souches de la collection du laboratoire ont également été réalisés. Ils permettent de caractériser de manière unique un plus grand nombre de souches. Enfin, une estimation du pourcentage de divergence nucléotidique existant entre les régions ribosomiques des génomes de ces souches a été réalisée
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Dates and versions

tel-01747792 , version 1 (29-03-2018)

Identifiers

  • HAL Id : tel-01747792 , version 1

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Cite

Catherine Colmin. Polymorphisme génétique et typage moléculaire chez la bactérie streptococcus salivarius subsp. thermophilus. Autre. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 1991. Français. ⟨NNT : 1991NAN10135⟩. ⟨tel-01747792⟩
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