Synthesis of Bis-nitrogen Containing Proline Analogous and Applications
Synthèse d'Analogues Bis-azotés de la Proline et Applications
Résumé
The peptidic bond in a peptide or a protein is usually flat and in trans conformation for the majority of amino acids. The situation is a little bit different upstream the proline: the thermodynamic barrier which opposes the rotation of the amide bond is weaker and the tendency of the bond to remain flat is lesser. So, this AA-Pro bond can adopt a cis conformation, leading to the formation of a turn in the peptidic chain. This work describes the synthesis and the chemical reactivity of new bis-nitrogen analogous of proline in solution to facilitate the cis conformation of a AA-PPro bond. The conformational impact that these residues may generate in pseudopeptides is also exposed.Initially, a new access road to the orthogonally protected and enantiomerically pure azaproline has been developed by exploiting previous work on the synthesis of hydrazinoesters and N-aminodipeptides. The study of the reactivity of this pseudoproline helped define the best conditions for forming pseudotripeptides of formula P1-AA1--azaPro-AA3-P3. It also guided the work, in a second step, towards the synthesis of pseudopeptide incorporating a pyrazole acid motif. Finally, the structure of the prepared compounds was analyzed by NMR, IR and molecular modeling. Examination of the P1-AA1-azaPro(Boc)-AA3-P3 revealed the formation of a pseudocycle C7 by a Hydrogen bond, favoring the trans conformation of the AA1-azaPro bond, while the absence of Boc function seems to favor the cis conformation of this bond.
La liaison peptidique au sein d'un peptide ou d'une protéine est d'ordinaire plane et en conformation trans pour la majorité des acides aminés. La situation est un peu différente en amont d'une proline : la barrière thermodynamique qui s'oppose à la rotation de la liaison amide est plus faible et la tendance de la liaison à rester plane est un peu moins grande. Cette liaison AA-Pro peut donc adopter une conformation cis, entraînant la formation d'un coude prononcé dans une chaîne peptidique à son niveau. Ce travail décrit la synthèse et la réactivité chimique de nouveaux analogues bis-azotés de la proline en solution permettant de favoriser la conformation cis d'une liaison AA-Pro. L'impact conformationnel que peut engendrer ces résidus au sein de pseudopeptides est également exposé. Dans un premier temps, une nouvelle voie d'accès à la azaproline énantiomériquement pure et orthogonalement protégée a été mise au point en exploitant des travaux antérieurs concernant la synthèse d'hydrazinoesters et de N-aminodipeptides. L'étude de la réactivité de cette pseudoproline a permis de définir les meilleures conditions de formations de pseudotripeptides de formule P1-AA1-azaPro-AA3-P3. Elle a également orienté les travaux, dans un second temps, vers la synthèse de pseudopeptides incorporant un motif acide pyrazolique. Enfin, la structure des composés préparés a été analysée par RMN, IR et par modélisation moléculaire. L'examen des P1-AA1-azaPro(Boc)-AA3-P3 a révélé la formation par liaison hydrogène d'un pseudocycle en C7, favorisant la conformation trans de la liaison AA1-azaPro, alors que l'absence de la fonction Boc favorise la conformation cis de cette liaison.
| Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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