Dans ce travail, on étudie le comportement des acides amines sur des colonnes anioniques fortes en chromatographie de déplacement. La maitrise du comportement dynamique des acides aminés sur les colonnes nécessite la connaissance des isothermes d'échange d'ions. Une première partie du travail est donc consacrée à l'étude théorique et expérimentale des isothermes des acides aminés. Pour modéliser l'équilibre d'échange d'ions on utilise un modèle basé sur l'hétérogénéité énergétique des sites d'échange. Ce modèle rend compte de la variation du coefficient de sélectivité avec le titre ionique en solution. Dans une deuxième partie, on applique une nouvelle technique permettant de minimiser l'utilisation des réactifs polluants : on utilise le CO2 dissout dans l'eau comme déplacer. En outre, on travaille avec des solutions d'acides aminés dans l'eau pure, sans tampons de pH. On montre que, dans les cas ou on élimine une grande partie des effets cinétiques et hydrodynamiques, on peut obtenir des produits purs et concentrés. On note que la qualité de la séparation dépend aussi des réactions de dissociation en solution. On présente alors, dans une dernière partie, l'effet du titre ionique en solution et de la sélectivité dans le cas de la chromatographie d'échange d'ions réactive.