Modeling electrostatic potential from x-x electron density in molecular crystals : eapplication to peptide compounds
Modélisation du potentiel électrostatique calcule a partir de la densité électronique de déformation X-X dans les cristaux moléculaires : application aux composés peptidiques
Résumé
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Cette étude est consacrée à la détermination de la densité électronique et du potentiel électrostatique à partir de mesures de diffraction X haute résolution. Elle est appliquée plus particulièrement au composé peptidique terbutyl co-proline-histidine-nhmethyle et une comparaison est faite avec d'autres molécules peptidiques étudiées au laboratoire (transactions aca, vol. 26). Le modèle de densité utilisé est celui de Hansen-Coppens, la formulation du potentiel électrostatique basé sur ce modèle est présentée (z. Naturforsch. 48a, 91-98) dans ce travail ainsi que l'ajustement du potentiel électrostatique par la méthode des moindres carrés de Householder. Les résultats concernant la densité électronique sont similaires aux études précédentes sur les groupements peptidiques communs. Nous avons montré que le potentiel électrostatique autour des mêmes groupements dépend de l'environnement. D'autre part le potentiel électrostatique aux alentours de la liaison hydrogène est très caractéristique. Supposant la densité électronique non perturbée par un changement de conformation moléculaire, nous avons montré que le groupement histidine présente le même potentiel électrostatique que celui donne par Stewart et Craven sur l'imidazole. L'ajustement du potentiel électrostatique pour la détermination de charges atomiques est excellent pour la contribution sphérique de la densité électronique, les charges obtenues sont pratiquement indépendantes de la conformation (acta cryst. A49, 781-789). La contribution de la densité de déformation non sphérique est plus délicate