Les virus entériques abondent dans le milieu hydrique et sont responsables de gastro-entérites aigües,d’hépatites, mais aussi d’autres pathologies comme la poliomyélite. La contamination de l’homme pardes virus entériques pathogènes peut notamment être due à la consommation d’eau ou d’alimentscontaminés. A l’heure actuelle, la détermination de la qualité microbiologique des eaux destinées à laconsommation est uniquement basée sur des indicateurs bactériens qui ne permettent pas uneévaluation satisfaisante du danger viral.Si la culture cellulaire permet de connaitre le statut infectieux des virus détectés, elle n’est pasapplicable à tous les virus entériques. Ainsi, les norovirus qui sont des virus entériques fortementimpliqués dans les cas de gastro-entérites ne sont pas cultivables. Les techniques de biologiemoléculaire comme la RT-PCR permettent quant à elles une détection rapide et spécifique du génomeviral. Cependant plusieurs études ont montré que le génome viral ne peut être utilisé comme marqueurde la présence de virus infectieux dans l’environnement. Devant ce constat, il apparait nécessaire dedévelopper de nouvelles méthodes de détection. Si les méthodes couplant la culture cellulaire à unedétection par biologie moléculaire fournissent des résultats rapides et permettent de conclure surl’infectiosité du virus, elles ne résolvent pas le problème lié à la nécessité de disposer d’une lignéecellulaire permissive du virus recherché. D’autres études se sont intéressées à l’intégrité de la capsidevirale ou du génome de façon indépendante. Cependant, le fait de ne pas prendre en compte la totalitéde la particule virale ne permet pas, avec les méthodes actuelles, d’évaluer son infectiosité. Pour ledéveloppement de nouvelles méthodes de détection des particules virales infectieuses, des pistespourraient être explorées concernant les modifications des interactions entre la capside et le génomelors de l’inactivation virale.