La mucoviscidose (ou fibrose kystique du pancréas) est la plus fréquente des maladies génétiques touchant les populations caucasiennes. Elle résulte du dysfonctionnement du gène codant la protéine CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator) qui joue un rôle dans le transport des ions chlorure. Au cours de cette affection, l'atteinte pulmonaire est quasiment constante et se caractérise par une détérioration progressive des fonctions respiratoires. Cette évolution est expliquée par la survenue d'épisodes infectieux répétés et liés à l'existence de micro-organismes colonisant de manière chronique le tractus respiratoire de ces patients.Le but de ce travail était d'étudier et de comparer les flores bactériennes respiratoires chez les patients mucoviscidosiques suivis au Centre de Ressources et de Compétences de la Mucoviscidose (CRCM) de Nancy en 1997 et 2007. Nous avons également évalué l'intérêt du milieu chromogène SAID (bioMérieux) pour la détection des "Staphylococccus aureus small colony variants" (SCV SA) en routine. Nous avons réalisé une étude rétrospective des données bactériologiques obtenues après analyse des prélèvements respiratoires des patients suivis au CRCM de Nancy en 1997 (n = 148) et en 2007 (n = 227). Une étude comparant les performances de deux milieux (gélose Columbia ANC additionnée de 5% de sang mouton et gélose SAID) pour la détection des SCV SA a été effectuée sur 122 prélèvements consécutifs obtenus chez 108 patients. La fréquence des bactéries isolées respectivement en 1997 et 2007 était de 70.9% et 65% pour Haemophilus spp., 58,1% et 58,1% pour S. aureus, 45,2% et 36,5% pour Pseudomonas aeruginosa, 9,5% et 2,2% pour Burkholderia cepacia, 3,3% et 3% pour Stenotrophomonas maltophilia, 1,4% et 3% pour Achromobacter xylosoxidans et 8,8% et 4,8% pour les autres bacilles à Gram négatif non fermentants. La résistance aux antibiotiques de P. aeruginosa observée respectivement en 1997 et en 2007 était de 30,8% et 58% pour la pipéracilline - tazobactam, 37,7% et 57% pour la ceftazidime, 36,5% et 58,5% pour l'imipénème, 40% et 42,7% pour la ciprofloxacine. Pour S. aureus, nous avons observé en 1997 et 2007, des taux de résistance respectifs de 12,2% et 27,4% pour la méticilline, 28,7% et 80,1% pour l'érythromycine, 14,7% et 37,7% pour la lincomycine, 3,4% et 19,2% pour la rifampicine et pour l'acide fusidique. La sensibilité est restée relativement stable pour la gentamicine, la pristinamycine, le cotrimoxazole et la minocycline. Entre 1997 et 2007, nous avons observé une relative stabilité de la fréquence d'isolement des principales espèces bactériennes habituellement isolés chez les patients mucoviscidosiques (P. aeruginosa, Haemophilus spp. et S. aureus) et une diminution significative de celle appartenant au complexe B. cepacia. L'utilisation du milieu SAID a permis d'augmenter la sensibilité de détection des SCV SA.