Introduction : Dans un contexte de développement de la recherche en médecine générale, la production de thèses de qualité et leur valorisation par des publications sont encouragées par les facultés. L'objectif de l'étude est de décrire les filières thèses en médecine générale dans toutes les facultés de France, de rechercher des critères d'évaluation et de proposer des pistes d'amélioration.Matériel et Méthodes : Enquête prospective, par soumission d'un questionnaire auxresponsables de l'encadrement des thèses de chaque faculté lors d'entretiens directs ou téléphoniques réalisés entre avril et septembre 2014.Résultats : Le choix du sujet et date de début des travaux sont laissés à l'étudiant. Des aides sont mises à disposition des étudiants dans toutes les facultés sous forme d'ateliers de groupe (85%) et/ou d'entretiens individuels (37%). 78% des départements de médecine générale ont adopté des fiches projets soumises à un conseil scientifique, proposant le recours à des aides extérieures (50%) et déterminant le potentiel de publication du travail fourni. Peu de facultés évaluent leurs filières thèses (15%). Leurs critères sont multiples : obtention de prix de thèse (75%), taux de publication (50%), questionnaires de satisfaction des directeurs de thèse (25%). La mise à disposition d'une liste de personnes ressources facilement identifiables, unaccompagnement adapté à chaque étape du parcours ou une valorisation plus systématique des travaux amélioreraient l'élaboration des thèses.Discussion : Une hétérogénéité des pratiques a été mise en évidence au sein des filières thèses de chaque faculté. De nouveaux outils, augmentant la qualité des projets et correspondant aux attentes des étudiants, ont été mis en place. Une évaluation régulière de l'encadrement des thèses permettrait d'améliorer son fonctionnement et de valoriser les travaux des étudiants par de nombreuses publications