Dans un contexte actuel d’économie d’énergie et de valorisation des déchets, le procédé de méthanisation apparait comme une alternative très intéressante pour le traitement des déchets. Il permet de produire du biogaz (méthane et dioxyde de carbone) ainsi qu’un digestat. Ce dernier, riche en éléments fertilisants, peut être utilisé comme amendement organique lors de l’épandage au champs. L’hygiénisation du digestat est très importante afin d’éviter un risque environnemental ou sanitaire lié à une contamination par des microorganismes pathogènes. Le procédé de méthanisation permet de réduire les concentrations en pathogènes mais un redéveloppement ou une recontamination peuvent être observés au cours du stockage. Le but de cette étude sera de regarder l’influence de différents facteurs biotiques (activité microbienne) et abiotiques (devenir de la matière organique) sur la dynamique de survie de 2 bactéries pathogènes (Listeria et Salmonella). Les résultats obtenus apporteront des informations clés permettant de mieux contrôler la survie des pathogènes et ainsi assurer des conditions de stockage optimales.