Epidemiological study of Fusarium infections over 10 years and molecular identification of species
Etude épidémiologique des infections à Fusarium au CHRU de Nancy sur 10 ans et identification moléculaire d’espèces
Abstract
Les champignons du genre Fusarium sont des moisissures largement distribuées dans l’environnement mais ne sont pas au premier plan des pathologies infectieuses humaines. Ainsi, les Fusarium sont beaucoup plus étudiés sur le volet environnemental que médical. Cette thèse, centrée sur l’intérêt médical, vise plusieurs objectifs. Outre une revue de la littérature, le premier objectif est épidémiologique : il s’agit de déterminer l'infectiosité locale au CHRU de Nancy et son évolution sur une période de 10 ans. Le deuxième objectif est pratique : il vise à évaluer et à améliorer la démarche diagnostique du laboratoire de Parasitologie-Mycologie du CHRU de Nancy en ce qui concerne l’identification des champignons du genre Fusarium. Après ce travail, un certain nombre de nos a priori ont été confirmés mais certaines surprises se sont révélées a posteriori. Ainsi d’un point de vue épidémiologique, un nombre croissant d’infection oculaire à Fusarium a été relevé et au niveau des pratiques de laboratoire, l’utilisation du gène EF1α et de la base de données spécifique à Fusarium s’avère prometteuse. Ce travail de thèse s’est donc inscrit dans une démarche de meilleure connaissance de l’épidémiologie locale et a permis une évaluation et une amélioration des pratiques au laboratoire de Mycologie du CHRU de Nancy.
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