Caractérisation fonctionnelle des protéines SSP1-like - Université de Lorraine Access content directly
Master Thesis Year : 2018

Caractérisation fonctionnelle des protéines SSP1-like

Abstract

During the wood-decay process, Phanerochaete chrysosporium is submitted to an "extractives" induced stress. Transcriptomic analysis on P. chrysosporium in the presence of wood extracts revealed an induction of genes which encode stress response proteins and small secreted protein with unknown function. The aim of this internship was the characterization of one of these proteins (SSP1). Based on the hypothesis that SSP1 could have an activity related to a Saccharomyces cerevisiae glucanosyl-transferase (Gas1), sequence(s) comparative analysis and functional complementation tests on Δgas1mutant argued against this hypothesis. Biochemical assays revealed a β–glucuronidase activity for SSP1, but the level was pretty low. SSP1 would possess a glycoside-cleavage activity, but with a different substrate. All of the SSP1 sequences, called SSP1-like, have been retrieved in order to study their distribution among fungi. The analysis evidenced that the presence of the gene was not related to the trophic mode. Determination of the role of the protein in wood decay process is still ongoing
Lors de la dégradation du bois le champignon Phanerochaete chrysosporium est soumis à des stress induits par la présence de composés appelés "extractibles". Les analyses de transcriptomiques menées sur P. chrysosporium en présence de ces extractibles ont révélé une induction de gènes codant des protéines de réponse au stress ainsi que des petites protéines sécrétées de fonction inconnue. L'objectif de ce stage a été de caractériser au niveau fonctionnel l'une d'entre elles (la protéine SSP1). En partant de l'hypothèse que SSP1 pourrait avoir une activité similaire à une glucanosyl-transférase (Gas1) de Saccharomyces cerevisiae, des analyses comparatives de séquences et des tests de complémentation fonctionnelle chez les mutants Δgas1 ont permis de contredire cette hypothèse. Les analyses biochimiques ont démontré une activité β-glucuronidase pour la protéine SSP1, mais de faible intensité. Cette dernière posséderait donc probablement bien une activité de clivage des sucres mais avec un substrat différent. L'ensemble des séquences de SSP1 appelées SSP1-like ont été recherchées pour étudier leur répartition au sein des champignons, et les analyses ont permis de montrer que la présence de ce gène n'était pas liée au mode trophique. Les analyses pour déterminer le rôle de cette protéine en lien avec la dégradation du bois sont toujours en cours.
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hal-02010585 , version 1 (07-02-2019)

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Cite

Thomas Bacchetta. Caractérisation fonctionnelle des protéines SSP1-like : approches biochimiques et physiologiques. Biotechnologies. 2018. ⟨hal-02010585⟩
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