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Conference papers

Étude multi-sites du transcriptome de dreissenidées

Résumé : Projet BIOMICS-convention ONEMA Titre : Étude multi-sites du transcriptome de dreissenidées En bio-surveillance, l'identification et l'utilisation de biomarqueurs nécessitent une caractérisation précise de la variation de ces biomarqueurs afin d'en affiner les niveaux d'expression et ainsi améliorer leur efficacité. Dans le projet Biomics, une partie de l'étude était ciblée sur les réponses moléculaires des deux bivalves modèles Dreissena polymorpha et Dreissena rostriformis bugensis. Ainsi deux transcriptomes de glandes digestives ont été réalisés à partir de 79 organismes issues de 15 sites du quart nord-est de la France présentant des niveaux de contaminations et de qualités physicochimiques de milieux contrastés. Ainsi, l'atout majeur de ces transcriptomes multipopulationnels est qu'ils contiennent les séquences de l'ensemble des ARNm exprimés en réponse à un large panel de contaminants. De plus, l'exploitation de ce jeu de données va permettre d'évaluer la variabilité du transcriptome intra-et inter-populations, en combinant une approche globale (transcriptome complet) et ciblée sur certaines fonctions biologiques. Ces transcriptomes assemblés sont maintenant disponibles à la communauté scientifique via une interface conviviale pour les non bioinformaticiens.
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03154937
Contributor : Bénédicte Sohm <>
Submitted on : Monday, March 1, 2021 - 2:21:31 PM
Last modification on : Wednesday, March 17, 2021 - 9:06:03 PM

Identifiers

  • HAL Id : hal-03154937, version 1

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Citation

Bénédicte Sohm, Simon Devin. Étude multi-sites du transcriptome de dreissenidées. Journée du GDR Ecotoxicologie Aquatique, Nov 2019, Bordeaux, France. ⟨hal-03154937⟩

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