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Master thesis

Mise en place du logiciel PELICAN, un outil de saisie de compte-rendu standardisé et de partage de données en anatomopathologie : application aux tumeurs pulmonaires et aux méningiomes

Résumé : INTRODUCTION : L'application PELICAN (« Partager Efficacement en Laboratoire les Informations des Comptes rendus Anatomopathologiques ») est un outil permettant de générer des comptes rendus standardisés et de créer des bases de données utilisables à viséescientifique. Cette application est utilisée dans notre laboratoire depuis 2014 en neuropathologie tumorale. Ce travail expose son extension à aux tumeurs pulmonaire, ainsi que sa première exploitation statistique sur les méningiomes. MATERIELS ET METHODES : Le contenu des comptes rendus était défini à l'aide de divers référentiels. Une double classification SNOMED et ADICAP était utilisée. L'application PELICAN est un fichier Microsoft Excel comportant un logiciel spécifiquement développé pour les laboratoires, écrit en Visual Basic pour Applications, respectant la norme CDA-R2. L'analyse statistique a porté sur une cohorte de méningiomes d'octobre 2014 à juillet 2018. RESULTATS : Concernant les tumeurs pulmonaires, après établissement du cahier des charges, une béta-version a été installé en février 2018 avec diverses mises à jour jusqu'à la version actuelle 3.19. La quasi-totalité des pièces d'exérèses fait aujourd'hui l'objet d'un compte rendu standardisé généré par l'application PELICAN. L'analyse statistique a porté sur 295 méningiomes dont 42 méningiomes de grade II. Elle a permis, entre-autres, d'observer une hyperplasie endothéliale dans 75% de ceux-ci versus 12% des méningiomes de grade I (p<0.002), ainsi qu'une diminution significative de l'expression des récepteurs de la progestérone et une surexpression de Ki-67 dans les méningiomes de grade II (p<0,001 et p<0,0001, respectivement). Dans les méningiomes de grade II, Ki-67 était corrélé de façon significative avec la survie sans progression. CONCLUSION : L'application est un outil d'utilisation facile, permettant de générer des comptes rendus standardisés pour les tumeurs pulmonaires et du système nerveux central, tout en alimentant une base de données facilement exploitable sur le plan statistique. Nous projetons de l'étendre à d'autres types tumoraux et d'y intégrer des outils statistiques supplémentaires.
Document type :
Master thesis
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https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03297404
Contributor : Thèses d'Exercice Ul Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Friday, July 23, 2021 - 1:49:55 PM
Last modification on : Thursday, November 18, 2021 - 3:45:46 AM

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BUMED_T_2018_YGUEL_CLEMENCE.pd...
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  • HAL Id : hal-03297404, version 1

Citation

Clémence Yguel. Mise en place du logiciel PELICAN, un outil de saisie de compte-rendu standardisé et de partage de données en anatomopathologie : application aux tumeurs pulmonaires et aux méningiomes. Médecine humaine et pathologie. 2018. ⟨hal-03297404⟩

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