Identification of partners involved in the illegitimate recombination system repairing DNA double-strand breaks in Streptomyces bacteria
Identification des partenaires impliqués dans le système de recombinaison illégitime réparant les cassures double-brin de l'ADN chez la bactérie Streptomyces
Abstract
Double-strand breaks in DNA are lethal damage to cells. Their repair is ensured, among other things, by the NHEJ (Non-Homologous End Joining) system, a system that generates mutations. Bacteria of the genus Streptomyces, known for their high chromosomal plasticity, have an NHEJ that is more complex in appearance than the two-component model described in prokaryotes. The many potential actors suggest the existence of several systems and their roles. The objective is to determine the possible interactions between the identified actors (3 Ku, 3 Pol and 2 Lig) using the bacterial double hybrid (BACTH) to reconstitute the NHEJ system(s) of Streptomyces ambofaciens. This internship was able to demonstrate the dimerization of Ku proteins and above all, their heterodimerization so far not demonstrated in prokaryotes
Les cassures double-brin de l’ADN constituent un dommage létal pour les cellules. Leur réparation est assurée, entre autres, par le système NHEJ (Non-Homologous End Joining), un système générateur de mutations. Les bactéries du genre Streptomyces, connues pour leur grande plasticité chromosomique, possèdent un NHEJ d’apparence plus complexe que le modèle à deux composants décrit chez les procaryotes. Les nombreux acteurs potentiels laissent supposer l’existence de plusieurs systèmes et leur rôle. L’objectif est de déterminer les interactions possibles entre les acteurs identifiés (3 Ku, 3 Pol et 2 Lig) à l’aide du double hybride bactérien (BACTH) afin de reconstituer le ou les systèmes NHEJ de Streptomyces ambofaciens. Ce stage a pu démontrer la dimérisation des protéines Ku et surtout, leur hétérodimérisation jusqu’ici non démontrée chez les procaryotes.