Solvant désordonné et le problème de phases en cristallographie macromoléculaire - Université de Lorraine Access content directly
Theses Year : 2003

Solvant désordonné et le problème de phases en cristallographie macromoléculaire

Abstract

In this thesis, we discuss several new aspects of the resolution of the phase problem in macromolecular crystallography using the information of the bulk solvent scattering density. First, we study the flat model of the disordered solvent, study the distribution of its diffraction parameters and propose a method to obtain their optimal values. Then we show that the criterion of the translation search, used in the frame of the molecular replacement method, can be improved if all low-resolution data are taken into account with the bulk-solvent correction. We propose a new approach to improve the Fourier syntheses by subtraction of the contribution of the bulk solvent. Finally, we study the procedure of ab initia phasing based on topological properties of Fourier syntheses and show that its results strongly depend on the solvent scattering density.
Dans ce mémoire, nous présentons quelques nouvelles méthodes d'utilisation de l'information sur la structure du solvant pour résoudre le problème des phases en cristallographie macromoléculaire. Nous étudions le modèle aplati du solvant désordonné, analysons la distribution des ses paramètres de diffraction et proposons une méthode pour obtenir leurs valeurs optimales. Nous démontrons que le critère de recherche de position moléculaire, dans le cadre de la méthode du remplacement moléculaire, peut être amélioré si toutes les données de basse résolution sont utilisées et la correction de solvant désordonné est introduite.Nous proposons une nouvelle approche d'amélioration des synthèses de Fourier par soustraction de la contribution du solvant. Nous étudions la procédure du phasage direct qui se base sur les propriétés topologiques des synthèses de Fourier et démontrons que les résultats du phasage dépendent fortement de la densité de dispersion du solvant.
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Dates and versions

tel-01746797 , version 1 (29-03-2018)

Identifiers

  • HAL Id : tel-01746797 , version 1

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Cite

Andrei Fokine. Solvant désordonné et le problème de phases en cristallographie macromoléculaire. Autre [cond-mat.other]. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 2003. Français. ⟨NNT : 2003NAN10019⟩. ⟨tel-01746797⟩
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