Modèles théoriques de la réaction d'hydrolyse enzymatique de peptides par la thermolysine - Université de Lorraine Access content directly
Theses Year : 1995

Modèles théoriques de la réaction d'hydrolyse enzymatique de peptides par la thermolysine

Serge Antonczak
  • Function : Author
  • PersonId : 758592
  • IdRef : 110498666

Abstract

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Nous avons abordé l'étude de la réaction d'hydrolyse de peptides par la thermolysine en utilisant différents modèles quantiques et mixtes (classique/quantique) de l'enzyme et du substrat. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés à un modèle très simple pour lequel des méthodes ab initio poussées ont été utilisées. L'hydrolyse du formamide a été analysée et nous avons examiné l'effet de la catalyse acide ainsi que celui du à l'introduction d'une deuxième molécule d'eau dans le mécanisme réactionnel (c.à.d. Catalyse bi fonctionnelle ou mécanisme assisté). Nous avons également étudié les effets électrostatiques du solvant. Les mécanismes d'hydrolyse assistés sont généralement préférés aux mécanismes non-assistés. Ce fait est renforcé dans le cas des processus catalysés par h#3o#+. Nous avons repris ces différentes réactions d'hydrolyse en utilisant un modèle relativement simple du site catalytique de la thermolysine. Cette étude a été réalisée à l'aide de méthodes semi-empiriques et dft. Le rôle joue par les ligands du zinc pour délocaliser la charge électronique vers le catalyseur a été mis en avant. Les résultats énergétiques et géométriques obtenus sont assez proches des valeurs de la catalyse acide. Enfin, l'utilisation d'une méthode mixte qm/mm, nous a permis d'aborder le processus enzymatique en tenant compte de l'ensemble de la structure de la thermolysine. Nous avons pu clarifier le double rôle géométrique et énergétique joué par les acides-aminés environnants. L'effet catalytique de la thermolysine est relativement faible dans le cas des mécanismes non-assistés et beaucoup plus important lors des processus assistés.
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Dates and versions

tel-01747540 , version 1 (29-03-2018)

Identifiers

  • HAL Id : tel-01747540 , version 1

Cite

Serge Antonczak. Modèles théoriques de la réaction d'hydrolyse enzymatique de peptides par la thermolysine. Chimie. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 1995. Français. ⟨NNT : 1995NAN10319⟩. ⟨tel-01747540⟩
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