Afin de répondre à une complexité croissante des systèmes de calcul, due notamment aux progrès rapides et permanents des technologies de l'information, de nouveaux paradigmes et solutions architecturales basées sur des structures auto-adaptatives, auto-organisées sont à élaborer. Ces dernières doivent permettre d'une part la mise à disposition d'une puissance de calcul suffisante répondant à des contraintes de temps sévères (traitement temps réel). D'autre part, de disposer d'une grande flexibilité et adaptabilité dans le but de répondre aux évolutions des traitements ou des défaillances non prévues caractérisant un contexte d'environnement évolutif de fonctionnement du système. C'est dans ce cadre que s'insèrent les travaux de recherche présentés dans cette thèse qui consistent à développer une architecture auto-organisée de type Reconfigurable MPSoC (Multi processor System on Chip) à base de technologie FPGA.