Modélisation d'inhibiteurs du domaine SH2 de la protéine Grb2 par dynamique moléculaire, docking et criblage virtuel
Abstract
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Ce manuscrit constitue une étude théorique de l'inhibition de l'activité du domaine SH2 de la protéine Grb2 par la liaison de ligands. La première partie décrit le contexte de ce travail, qui se situe plus généralement à travers le ciblage de Grb2 SH2 parmi les multiples approches de lutte contre le cancer, de l'étude du vivant à l'échelle moléculaire (domaine interdisciplinaire par excellence), et, plus précisément, de la recherche pharmaceutique. La seconde partie s'emploiera à détailler les connaissances disponibles sur la cible au moment de débuter ce travail, en incluant les avancées qui sont apparues en parallèle à ce travail. On trouvera dans la troisième partie un résumé des principaux résultats obtenus au cours de cette thèse. Ceux-ci se classent selon trois approches méthodologiques distinctes : celle de la dynamique moléculaire, du docking et enfin du screening virtuel. On pourra constater que de nouvelles connaissances sur la nature physico-chimique de la liaison de certains ligands sur Grb2 SH2 sont mises en évidence dans le premier cas, tandis que les deux autres approches ont surtout donné naissance à des avancées méthodologiques.
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