Une connaissance approfondie des peuplements végétaux en cours d'eau et des paramètres d'environnement qui les conditionnent est apparue indispensable, en raison des nuisances occasionnées par les proliférations, de plus en plus fréquentes, de macrophytes. Avec la mise en place d'une méthodologie de description et de formalisation des paramètres abiotiques de l'écosystème rivière, l'établissement d'une typologie des cours d'eau par les végétaux aquatiques a alors été envisagé. L'échantillonnage s'est porté sur vingt et un cours d'eau, sélectionnés pour leur situation en tête de bassin versant et leur représentativité de la diversité géologique de la Lorraine. Un découpage abiotique a été réalisé en fonction du substrat géologique, de la pente et de la largeur du cours d'eau. Chaque tronçon homogène ainsi déterminé a fait l'objet d'une prospection sur le terrain pour le choix d'une station végétale représentative. L'étude des végétaux aquatiques repose sur un relevé floristique qualitatif et quantitatif (à l'aide des pourcentages de recouvrement) des espèces présentes. L'étude des descripteurs d'environnement inclut, quant à elle, des mesures morphométriques, des dosages chimiques ainsi qu'une quantification de l'éclairement parvenant à la surface de l'eau sur chaque station. Cette analyse a permis de mettre en évidence quatre grands types de cours d'eau: sur granites, sur grès, sur calcaires et sur marnes. La pertinence de l'utilisation du substrat géologique comme premier critère hiérarchique de classification des cours d'eau est ainsi confirmée. Les macrophytes montrent de réelles successions longitudinales, par des variations qualitatives et également quantitatives des espèces présentes. Ces successions sont comparées avec des zonations établies dans d'autres régions ou pays. Des analyses multivariées, suivies de classifications ascendantes hiérarchiques, ont corrélé des paramètres de chimie de l'eau, de morphométrie et d'environnement à des espèces végétales. Ces corrélations ont été confirmées par l'étude des profils écologiques des espèces végétales. Cette thèse a conduit à l'élaboration d'une typologie des cours d'eau de Lorraine utilisant la végétation aquatique. Elle a permis de parfaire la connaissance des phytocénoses lorraines existantes, de tester une méthode de caractérisation des cours d'eau par la végétation aquatique et d'approfondir la notion de bioindication par les végétaux aquatiques