Deciphering the molecular mechanisms of the assembly of macromolecular complexes : snoRNP as a working model
Décryptage des mécanismes moléculaires d’assemblage de complexes macromoléculaires ARN/protéine : la snoRNP C/D comme modèle de travail
Abstract
In eukaryotes, the production of functional ribosomes involves a frequent modification, the 2'OH methylation of the pre-rRNA riboses. An RNA/protein complex catalyzes this reaction, termed the C/D box snoRNP. The assembly of its core proteins in the yeast S. cerevisiae (Snu13p, Nop58p, Nop56p, Nop1p) with its guide RNA (snoRNA with C/D boxes), involves assembly proteins in a transient manner, ensuring a fine regulated chronology. The Bcd1p protein is an essential factor in this assembly. It has been identified in the laboratory as being necessary for the correct deposition of Nop58p on the C/D box snoRNA. During this thesis work we sought to characterize the early transitional complexes of assembly, including the Bcd1 protein. The Rvb1/Rvb2 ATPase machinery is closely linked to the role of Bcd1p. Structural biochemical characterization of the Rvb1/Rvb2/Bcd1p complex suggests significant conformational flexibility."snoRNA with C/D boxes" doit être remplacée par "C/D box snoRNA" ; "The Bcd1p protein" doit être remplacée par "The Bcd1 protein" ; "During this thesis work" doit être remplacée par "During this thesis work," ; "suggests significant conformational flexibility" doit être remplacée par "suggests significant quaternary structure flexibility depending on the nucleotides".
Chez les eucaryotes la production de ribosomes fonctionnels implique une modification fréquente, la méthylation en 2'OH des riboses du pré-ARNr. Un complexe ARN: protéine catalyse cette réaction, nommé snoRNP à boîtes C/D. L'assemblage de ses protéines coeur chez la levure S. cerevisiae (Snu13p, Nop58p, Nop56p, Nop1p) avec son ARN guide (snoARN à boîtes C/D), fait intervenir des protéines d'assemblage de façon transitoire, assurant une chronologie finement régulée. La protéine Bcd1p est un facteur essentiel de cet assemblage. Elle a été identifié au laboratoire comme étant nécessaire à la déposition correcte de Nop58p sur le snoARN à boîtes C/D. Durant ce travail de thèse nous avons cherché à caractériser les complexes transitoires précoces de l'assemblage, comprenant la protéine Bcd1. La machinerie ATPasique Rvb1/Rvb2 est étroitement liée au rôle de Bcd1p. La caractérisation biochimique structural du complexe Rvb1/Rvb2/Bcd1p suggère une flexibilité conformationnelle importante."La protéine Bcd1p" doit être remplacée par "La protéine Bcd1"; "Elle a été identifié" doit être remplacée par "Elle a été identifiée" ; "Durant ce travail de thèse" doit être remplacée par "Durant ce travail de thèse," ; "flexibilité conformationnelle importante" doit être remplacée par "flexibilité de structure quaternaire importante en fonction des nucléotides".
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