La séparation et la quantification des isomères Z-E constituent des objectifs importants pour l'analyste, en particulier lorsqu'il s'agit de composés d' intérêt pharmaceutique. A l'instar du cas du tamoxifène, ces isomères peuvent posséder des caractéristiques biologiques, pharmacologiques ou toxicologiques fondamentalement différentes. A travers l' exemple de trois molécules actuellement utilisées en thérapeutique, deux approches séparatives différentes sont envisagées : CLHP sur support carbone graphite poreux et électrophorèse capillaire en présence d'un sélecteur (dé rivé cyclodextrine). Après avoir décrit les étapes intervenues au cours du développement, les deux procédures sontcomparées aux méthodes de référence décrites dans la Pharmacopée Européenne. Quel que soit l'analyse considérée, les deux approches testées permettent d'obtenir des temps d' analyse réduits combinés à une qualité de séparation au moins équivalente à celle des méthodologies officielles.