Potentiel de transformation de souches d'intérêt de Streptococcus salivarius pour l'étude du transfert d'Eléments Intégratifs et Conjugatifs - Université de Lorraine Access content directly
Master Thesis Year : 2014

Potentiel de transformation de souches d'intérêt de Streptococcus salivarius pour l'étude du transfert d'Eléments Intégratifs et Conjugatifs

Abstract

Streptococcus salivarius is a human commensal bacteria that can be an opportunistic pathogen. Genomic sequencing of selected strains allowed us to highlight the presence of mobile genetic elements type Integrative and Conjugative Elements (ICE). They carry accessory loci that could confer selective advantage to its host (antibiotics or phage resistance or pathogenicity properties). In order to study ICE transfer between different strains of S. salivarius, a reporter system based on a set of plasmid construction was developed. During my M2 project I studied, in silico and in vitro, the potential of natural transformation (competence) of S. salivarius strains of interest to labeled the ICE for transfer experiments. As streptococci competence depend on quorum-sensing system, different times and quantities of signal peptide and DNA were tested. To increase competence level, recovery kinetic was done to fix the time for foreign DNA integration and expression. All of these experiments allowed us to measure competence level of S. salivarius interest strains.
Streptococcus salivarius est une bactérie commensale de l'homme pouvant être un pathogène opportuniste. Le séquençage du génome d'une sélection de souches a permis de mettre en évidence la présence d'éléments génétiques mobiles de type éléments intégratifs et conjugatifs (ICE). Ces derniers présentent des parties variables pouvant donner un avantage sélectif à l'organisme porteur (résistances aux antibiotiques, aux phages ou encore un pouvoir pathogène). Afin d'étudier le transfert des ICE entre différentes souches de S. salivarius, un système de suivi, basé sur un ensemble de constructions plasmidiques a été conçu. Lors de mon stage de M2, j'ai réalisé une étude in silico et in vitro afin d'apprécier le potentiel de transformation naturelle (compétence) des souches d'intérêt de S. salivarius afin de marquer les ICE pour les expériences de transfert. La mise en place de la compétence chez les streptocoques étant liée à la présence d'un système de quorum-sensing, l'ajout du peptide signal et de l'ADN exogène a été réalisé à différents temps et différentes concentrations. Dans un but d'optimisation, une cinétique de régénération des cellules (temps nécessaire à l'intégration et expression de l'ADN acquis) a été testée. L'ensemble de ces expériences ont permis de mesurer le niveau de compétence de souches d'intérêt de S. salivarius.
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hal-01843164 , version 1 (18-07-2018)

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  • HAL Id : hal-01843164 , version 1

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Cite

Yoann Perrin. Potentiel de transformation de souches d'intérêt de Streptococcus salivarius pour l'étude du transfert d'Eléments Intégratifs et Conjugatifs. Microbiologie et Parasitologie. 2014. ⟨hal-01843164⟩
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